يمكن تتبع خطوات التنقية والذي يتوقف على:

1- اختيار مصدر للإنزيم.

2- طرائق تحليل (أو) تكسير) الخلايا لاستخلاص الإنزيمات.

1- اختيار مصدر للإنزيم

يتوقف اختيار مصدر الإنزيم الذي سيجري عليه عملية التنقية على عدة عوامل منها:

أ- مدى توفر الإنزيم من الضروري اختيار المصدر الذي يحتوي على تركيز عال من الإنزيم المراد

استخلاصه في غياب العوامل الأخرى.

ب- المصادر المتاحة: يجب ان يكون المصدر المتاح للحصول على الإنزيم اقتصادياً وأمنـــا Safe ومن السهولة الحصول عليه.

2- طرائق تحليل (أو تكسير) الخلايـا لاستخلاص الإنزيمات طـرق التجنــيس Methods of homogenization

توجد العديد من طرائق تكسير الخلايا لاستخلاص محتوياتها، وتعتمد اختيار الطريقة المناسبة على نـوع الأنسجة أو نوع الكائن الحي الذي يستخدم مصدراً للحصول على الإنزيم.

أ- أنسجة اللبائن Mammalian tissues

من المعروف ان عملية التجنيس يمكن إجراؤها في معظم الأحوال بسهولة في الأنسجة الحيوانية وذلك لعدم صلابة تلك الأنسجة. فغالباً ما يجري تقطيع النسيج الى قطع صغيرة أو فرمه قبل عملية التجنيس فــــي المجنس Homogenizer، أو استخدام خلاط ذي سرعة عالية وفي هذه الحالة فمن الأهمية عند إجـراء الاستخلاص تجنب حدوث التلوث بالكائنات الحية الدقيقة وذلك باستخدام محلول متساوي التوتر Isotonic وهذه الخطوة تكون هامة بصفة رئيسة في حالة تجنيس أنسجة بعض أنواع الغدد مثل الكبد والذي يحتوي على عدد كبير من اللايسوزومات Lysosomes ، وفي حالات أخرى يجب أن يكون وسط التجنيس ذا قـوة أيونية منخفضة بحيث يحتوي على 0.01 مول من كلوريد الكالسيوم الذي يستخدم في الغالب فـي وسـط الاستخلاص. ومن الضروري إضافة مثبطات إنزيمية للإنزيمات البروتينية أو أي مواد أخرى مختزلة لمنـــع تلف الإنزيم أثناء خطوات الاستخلاص.

ب- الأنسجة النباتية والفطرية والبكتريا Plant, fungal and bacterial

تستخدم الطرائق القياسية عادة في مثل هذه النوعيات من المواد حيث يكون الجدار المحيط بهذه الخلايا صلباً وعلى ذلك يجري الاستخلاص بالاحتكاك في وجود مواد كاشطة Abrasives مثل الألومينا أو الرمــــل أو إتمام الاستخلاص باستخدام جهاز الموجات فوق الصوتية Ultrasonic أو بالتجميد والتذويب أو باستعمال الخلاط لمدة طويلة أو بإضافة كريات الزجاج Glass beads أثناء استعمال الخلاط.