ترتبط بعض الصفات بأحد كروموسومي الجنس بحيث إن الجينات المسئولة عن هذه الصفات موجودة على أحد هذه الكروموسومات ولا يوجد لها أليل على کروموسوم الجنس الآخر.

وتوجد أغلب الصفات المهمة والتي لها تأثير على صفات حيوية في الكائن الحي مرتبطة بكروموسوم (X) وهناك جينات أخرى قليلة مرتبطة بكروموسوم (Y).

بالإضافة إلى أن كروموسوم (X) يحمل العديد من الجينات بينما كروموسوم (Y) يحمل عدداً قليلاً جداً من الجينات. ومن أمثلة الجينات المرتبطة بكروموسوم (X) ما يلي:

1 - صفة العيون البيضاء في الدروسوفيلا

قام «مورجان» بتلقيح ذكر أحمر العيون مع أنثى بيضاء العيون، وحصل على إناث حمراء العيون وذكور بيضاء العيون في الجيل الأول. استنتج «مورجان» من تجاربه أن صفة العيون البيضاء موجودة على كروموسوم (x) وليس لها أليل على كروموسوم (Y).

* صفة العيون الحمراء يتحكم فيها الجين السائد (R) وهو جين سائد على أليله المتنحي (r) المسئول عن العيون البيضاء.

* الأنثى النقية لصفة العيون الحمراء يكون تركيبها الجيني ← X^RX^R

* ذکر دروسوفيلا ذو عيون حمراء يكون تركيبة الجيني ← X^RY

ويمكن تتبع التجربة التي قام بها مورجان» على النحو التالي.

يلاحظ أن صفة اللون الأبيض للعيون تنتقل من أحد الجنسين إلى الآخر وهو نظام تبادلي خاص بكروموسوم (X) وأن النتيجة التي حصلنا عليها لا تتبع قوانين مندل. يسمى ذلك بالوراثة التصالبية (Cross inheritance).

2- صفة لون الجسم الأصفر في الدروسوفيلا

صفة لون الجسم الأصفر في حشرات الدروسوفيلا هي من الصفات المرتبطة بالجنس وهي صفة متنحية أمام صفة لون الجسم الرمادي، وتسلك هذه الصفة في توارثها نفس سلوك صفة العيون البيضاء. فعند تلقيح إناث صفراء اللون مع ذكور رمادية الجسم كانت أفراد الجيل الأول مؤلفة من ذكور صفراء الجسم وإناث رمادية الجسم.

يلاحظ بأن النتيجة التي تم الحصول عليها في كلا الصفتين (لون العيون ولون الجسم) لا تتبع قوانين مندل في توارث الصفات. كما أن هناك اختلافاً في توارث هذه الصفات بين الجنسين حيث يلاحظ أن جميع أفراد الجيل الأول الذكور تحمل الصفات المرتبطة بالجنس الآتية من الأم، بينما كانت الإناث تحمل صفة الآباء وهو ما يسمى بالوراثة التصالبية "Cross inheritance".