قال الشيخ المفيد (رحمه اللّه)  : كان الصادق جعفر بن محمد بن عليّ بن الحسين (عليهم السّلام) من بين إخوته خليفة أبيه محمد بن عليّ (عليه السلام) و وصيّه القائم بالامامة من بعده و برز على جماعتهم بالفضل و كان أنبههم ذكرا و أعظمهم قدرا و أجلّهم في العامة و الخاصة، و نقل الناس عنه من العلوم ما سارت به الركبان و انتشر ذكره في البلدان و لم ينقل عن أحد من أهل بيته العلماء ما نقل عنه و لا لقى أحد منهم من أهل الآثار و نقلة الأخبار و لا نقلوا عنهم كما نقلوا عن أبي عبد اللّه (عليه السلام) .

فانّ أصحاب الحديث قد جمعوا اسماء الرواة عنه من الثقات على اختلافهم في الآراء و المقالات فكانوا أربعة آلاف رجل، و كان له (عليه السلام) من الدلائل الواضحة في امامته ما بهرت القلوب و أخرست المخالف عن الطعن فيها بالشبهات.

و قال السيد الشبلنجي الشافعي : و مناقبه كثيرة تكاد تفوت عد الحاسب، و يحار في أنواعها فهم اليقظ الكاتب ؛ روى عنه جماعة من أعيان الأئمة و أعلامهم كيحيى بن سعيد و مالك بن أنس و الثوري و ابن عيينة و أبي حنيفة و أيوب السختياني و غيرهم‏ .

و قال ابن قتيبة في أدب الكاتب ما معناه : انّ كتاب الجفر كتبه جعفر الصادق (عليه السلام) و فيه ما يحتاج الناس إلى العلم به إلى يوم القيامة و قد أشار إلى هذا الجفر أبو العلاء المعرّي حيث قال :

لقد عجبوا لآل البيت لما          اتاهم علمهم في جلد جفر

و مرآة المنجم و هي صغرى‏    تريه كل عامرة و قفر

وهناك روايات كثيرة تشير إلى أنّ الامام (عليه السلام) كان له مجلس للعامة و الخاصة من الناس، و كانوا يأتونه من أقصى بقاع الأرض و يسألونه عن الحلال و الحرام و تأويل القرآن، و كان قوله فصل الخطاب و لم يخرج منه أحد الّا بجواب مرض و واف.

يقول هذا الفقير : الظاهر كون هذا المجلس في موسم الحج وعلى كل حال لم ينقل من أحد غيره مثل هذه العلوم التي نقلت عنه (عليه السلام) و لم يظهر من علمه عشر معشاره مع كون الرواة عنه أربعة آلاف نفر، و امتلاء الكتب و المتون بأحاديثه و علومه بل ما ظهر منه بمنزلة قطرة من بحر خضم.

و قيل انّ بعض علماء العامة كانوا من تلامذته و خدّامه و أتباعه كأبي حنيفة و محمد بن الحسن و أبي يزيد طيفور السّقا الذي خدم الامام (عليه السلام) و سقاه و كإبراهيم بن الأدهم و مالك بن دينار.