أقرأ أيضاً
التاريخ: 10-3-2021
1958
التاريخ: 2-6-2018
1254
التاريخ: 27-12-2015
2445
التاريخ: 6-12-2015
1753
|
الأطلس BLAST Atlas
اطالس تعتمد على نتائج برنامج BLAST لإجراء المقارنات وذلك لربط برامج رسم الأطالس مع BLAST لتحقيق هذا الغرض . ويمكن بواسطة هذا البرنامج وضع خرائط للحوامض الامينية والنيوكلوتيدات التي تشفر لها بعد الربط بالبرامج الخاصة بها مثل BLASTn للنيوكلوتيدات او BLASTp للبروتينات او غيرها من إصدارات برنامج BLAST وفق الغرض المطلوب . والبرنامج يمكن ان يربط مع ACT لمقارنة 2 او أكثر من الجينومات ، وتتفق وسائل رسم أطالس المقارنة بوجود جينوم مرجعي وبذلك يمكن تحديد الجينوم الشامل والجينوم المركزي . وفي هذا النوع منالأطالس يتم تحديد التطابقات Matches ودرجاتها بالاعتماد على الشفرات اللونية التي تستعمل نظام RGB (نظام Red, Green , Blue في التلوين ) على مقياس 0 - 10 وتكون القيم المتوسطة بلون رمادي فاتح . وفيمثل هذه البرامج يمكن التحكم بالصفات المراد دراستها بما توفره في خيارات مثل نوعية جزيئة DNA هل هي حلقية ام مفتوحة واطر القراءة المفتوحة ومتجاورات الكروموسوم وصفات أخرى على ان تكون متوفرة في الجينوم المرجعي لذلك يكون من الأفضل استعمال اكبر جينوم موجود كمرجع وكلها تجمع وتعالج بالبرنامج دون الحاجة الى تدخل المستخدم . بعض أطالس تكون بشكل دوائر متحدة المركز ) في اغلب الأحيان ووفق الطلب ( ومعها المؤشرات المستعملة . وفي الوقت الحاضر توفر هذه الوسائل مقارنة عشرات الجينومات ولكن الطموح الى المئات والآلاف من التواليات قائما" . ويمكن استعمال مثل هذه الأطالس لرسم أطالس الجينومات البيئية ورسم الجينات بغض النظر عن اصوالها بالاستناد الى جينوم مرجعي والشكل التالي يوضح احد هذه الأطالس باستعمال جينوم Pelotomaculum thermopropionicum كمرجع لانه من الجينومات الكبيرة .
ونظرا" لكثرة الجينومات المستعملة فضلا" عن قلة التطابقات ( BLAST Hits) الموجودة في النماذج البيئية يلاحظ ان الألوان تكون باهتة . ويظهر الشكل مقارنة 31 نوع من أجناس بكتيرية مختلفة .
|
|
حمية العقل.. نظام صحي لإطالة شباب دماغك
|
|
|
|
|
إيرباص تكشف عن نموذج تجريبي من نصف طائرة ونصف هليكوبتر
|
|
|
|
بمشاركة 60 ألف طالب.. المجمع العلمي يستعدّ لإطلاق مشروع الدورات القرآنية الصيفية
|
|
صدور العدد الـ 33 من مجلة (الاستغراب) المحكمة
|
|
المجمع العلمي ينظّم ورشة تطويرية لأساتذة الدورات القرآنية في كربلاء
|
|
شعبة التوجيه الديني النسوي تختتم دورتها الثانية لتعليم مناسك الحجّ
|