قال الشيخ المفيد (رحمه الله) في باب ذكر الإمام القائم بعد أبي جعفر محمد بن علي (عليه السلام) من ولده و تاريخ مولده و دلائل إمامته و مبلغ سنه و مدة خلافته و وقت وفاته و موضع قبره و عدد أولاده و مختصر من أخباره.

وكان الصادق جعفر بن محمد بن علي بن الحسين (عليه السلام) من بين إخوته خليفة أبيه و وصيه و القائم بالإمامة من بعده و برز على جماعتهم بالفضل و كان أنبههم ذكرا و أعظمهم قدرا و أجلهم في العامة و الخاصة و نقل الناس عنه من العلوم ما سارت به الركبان و انتشر ذكره في البلدان و لم ينقل العلماء عن أحد من أهل بيته ما نقل عنه و لا لقي أحد منهم من أهل الآثار و نقلة الأخبار و لا نقلوا عنهم ما نقلوا عن أبي عبد الله (عليه السلام) فإن أصحاب الحديث قد جمعوا أسماء الرواة عنه من الثقات على اختلافهم في الآراء و المقالات فكانوا أربعة آلاف رجل و كان له (عليه السلام) من الدلائل الواضحة في إمامته ما بهرت العقول و أخرست المخالف عن الطعن فيها بالشبهات.

وكان مولده بالمدينة سنة ثلاث و ثمانين و مضى (عليه السلام) في شوال من سنة ثمان و أربعين و مائة و له خمس و ستون سنة و دفن في البقيع مع أبيه و جده و عمه الحسن (عليه السلام) و أمه أم فروة بنت القاسم بن محمد بن أبي بكر و كانت إمامته (عليه السلام) أربعا و ثلاثين سنة و وصى إليه أبو جعفر (عليه السلام) وصية ظاهرة و نص عليه بالإمامة نصا جليا.

فروى محمد بن أبي عمير عن هشام بن سالم عن أبي عبد الله جعفر بن محمد (عليه السلام) قال لما حضرت أبي الوفاة قال يا جعفر أوصيك بأصحابي خيرا قلت جعلت فداك و الله لأدعنهم و الرجل منهم يكون في المصر فلا يسأل أحدا.

وروى أبان بن عثمان عن أبي الصباح الكناني قال نظر أبو جعفر إلى ابنه أبي عبد الله (عليه السلام) و قال أ ترى هذا من الذين قال الله تعالى {وَنُرِيدُ أَنْ نَمُنَّ عَلَى الَّذِينَ اسْتُضْعِفُوا فِي الْأَرْضِ وَنَجْعَلَهُمْ أَئِمَّةً وَنَجْعَلَهُمُ الْوَارِثِينَ} [القصص: 5] و روى هشام بن سالم عن جابر بن يزيد الجعفي قال سئل أبو جعفر الباقر (عليه السلام) عن القائم بعده فضرب يده على أبي عبد الله (عليه السلام) فقال هذا والله بعدي قائم آل محمد.