يدل على إمامته (عليه السلام )  بعد طريقة الاعتبار وطريقة التواتر وما ثبت من إشارة أبيه إليه بالاِمامة ورواه الثقات من أصحابه وأهل بيته عنه مثل عمّه عليّ بن جعفر الصادق (عليه السلام ) ، وصفوان بن يحيى ومعمر بن خلاّد وابن أبي نصر البزنطي والحسين بن بشار وغيرهم .

فروى محمد بن يعقوب عن عليّ بن إبراهيم عن أبيه وعليّ بن محمد القاسانيّ جميعاً عن زكريّا بن يحيى قال : سمعت عليّ بن جعفر يحدّث الحسن بن الحسين بن عليّ بن الحسين فقال في حديثه : لقد نصر الله أبا الحسن الرضا (عليه السلام ) لمّا بغى عليه أخوته وعمومته . وذكر حديثاً طويلاً حتىّ انتهى إلى قوله : فقمت وقبضت على يد أبي جعفر محمد بن عليّ الرضا (عليهما السلام) وقلت : أشهد أنّك إمامي عند الله فبكى الرضا (عليه السلام ) ثمّ قال : يا عمّ ألم تسمع أبي وهو يقول : قال رسول الله (صلّى الله عليه وآله) بأبي ابن خيرة الاِماء النوبيّة الطيّبة يكون من ولده الطريد الشريد الموتور بأبيه وجدّه صاحب الغيبة يقال : مات أوهلك أيّ واد سلك ؟ فقلت : صدقت جعلت فداك .

وعنه عن محمد بن يحيى عن أحمد بن محمد عن صفوان بن يحيى قال : قلت للرضا (عليه السلام ) : قد كنّا نسألك قبل أن يهب الله لك أبا جعفر فكنت تقول : يهب الله لي غلاماً فقد وهبه الله لك فأقرّ عيوننا فلا أرانا الله يومك فإن كان كونٌ فإلى من ؟ فأشار بيده إلى أبي جعفر (عليه السلام ) وهو قائم بين يديه فقلت له : جعلت فداك هذا ابن ثلاث سنين ؟! قال : وما يضرّه من ذلك قد قام عيسى بالحجّة وهو ابن أقلّ من ثلاث سنين .

وعنه عن محمد بن يحيى عن أحمد بن محمد عن معمر بن خلاد قال : سمعت الرضا (عليه السلام ) وذكر شيئاً فقال : ما حاجتكم إلى ذلك هذا أبوجعفر قد أجلسته مجلسي وصيّرته مكاني.

وقال : إنّا أهل بيت يتوارث أصاغرنا عن أكابرنا القُذّة بالقُذّة .

وعنه عن بعض أصحابنا عن محمد بن عليّ عن معاوية بن حكيم عن ابن أبي نصر البزنطي قال : قال لي ابن النجاشيّ : من الاِمام من بعد صاحبك ؟ ولم يكن رزق أبا جعفر فدخلت على الرضا (عليه السلام ) فأخبرته بما سألني عنه ابن النجاشيّ فقال : الاِمام بعدي ابني ثم قال : وهل يجترئ أحدٌ أن يقول ابني وليس له ولد ؟!.

وعنه عن عدّة من أصحابه عن أحمد بن محمد عن جعفر بن يحيى عن مالك بن أشيم عن الحسين بن يسار قال : كتب ابن قياما إلى أبي الحسن الرضا (عليه السلام ) كتاباً يقول فيه : كيف تكون إماماً وليس لك ولد ؟ فأجابه أبوالحسن (عليه السلام ) : وما علمك أنّه لا يكون لي ولد والله لا تمضي الاَيّام والليالي حتّى يرزقني الله ذكراً يفرّق بين الحقّ والباطل .

وعنه عن الحسين بن محمد عن الخيراني عن أبيه قال : كنت واقفاً بين يدي أبي الحسن (عليه السلام ) بخراسان فقال له قائلٌ : يا سيّدي إن كان كون فإلى من ؟ قال : إلى أبي جعفر ابني  .

 فكأنّ القائل استصغر سنّ أبي جعفر فقال أبوالحسن (عليه السلام ) : إنّ الله بعث عيسى بن مريم رسولاً نبيّاً صاحب شريعة مبتدأة في أصغر من السنّ الذي هو فيه .

وعنه عن عليّ بن محمد عن سهل بن زياد عن محمد بن الوليد عن يحيى بن حبيب الزيّات قال : أخبرني من كان عند الرضا (عليه السلام ) جالساً فلمّا نهضوا قال لهم : ألقوا أبا جعفر فسلّموا عليه وأحدثوا به عهداً فلمّا نهض القوم إلتفت إليّ فقال : رحم الله المفضّل إنّه كان ليقنع بدون هذا.

وعنه عن أحمد بن محمد عن محمد بن عليّ عن الحسن بن الجهم قال : كنت مع أبي الحسن الرضا (عليه السلام ) جالساً فدعا بابنه وهو صغير فأجلسه في حجري وقال لي :جرّده  أي انزع قميصه ؛ فنزعته فقال : انظر بين كتفيه فنظرت فإذا في إحدى كتفيه شبيه بالخاتم داخل في اللحم فقال لي أترى هذا ؟ كان مثله في هذا الموضع من أبي (عليه السلام ) .

وعنه عن أحمد بن محمد عن محمد بن عليّ عن أبي يحيى الصنعانيّ قال : كنت عند أبي الحسن الرضا (عليه السلام ) فجيء بابنه أبي جعفر وهو صغيرٌ فقال : هذا المولود الذي لم يولد مولودٌ أعظم بركة على شيعتنا منه .