الطرق الكيميائية المستخدمة للتعرف على التركيب الاولي للاحماض النووية

1. تأثير القواعد : من الطرق المهمة المستخدمة في التعرف على التركيب الابتدائي للأحماض النووية طرق التميؤ (الإماهة) بواسطة هيدروكسيد الصوديوم، او هيدروكسيد البوتاسيوم. اذ لوحظ عند معاملة جزيئة الرايبونيوكليوتيد المتعدد (RNA) مع محلول هيدروكسيد الصوديوم (0.1) عياري ولمدة (20) دقيقة عند درجة الحرارة (100)̊ م تفكك هذه الجزيئة الى مزيج من (2 و 3) رايبونيوكليوتيد. وتتضمن ميكانيكية التفاعل تكوين مركب حلقي من نوع (2,3 Cyclic – phosphate)، وان ظهور المركب الوسطي 2- رايبونيوكليوتيد يمكن تفسيره بسبب انتقال مجموعة الفوسفات من مكانها الطبيعية في الموقع (5) الى الموقع (2) وفق المعادلة التالية :

والشكل التالي يوضح مواقع تأثير هيدروكسيد الصوديوم على جزيئة الـ RNA.

لاحظ التأثير يكون بكسر الرابطة الاسترية الفوسفاتية مع ذرة الكربون (5).

لم يلاحظ ان تأثير لمحلول هيدروكسيد الصوديوم (0.1) عياري على جزيئة الـ DNA والسبب يعود الى عدم وجود مجموعة الهيدروكسيل في الموقع (2) في سكر الديوكسي رايبوز. الأمر الذي يمنع تكون المركب الوسطي الحلقي والذي يعتبر من شروط حدوث عملية الكسر باستخدام القواعد القلوية.

2. تأثير الحامض : تتحلل جزيئة الـ RNA عند معاملتها مع محلول حامضي لتعطي البيورين والفوسفات العضوي والبيريميدين – 3 – أحادي النيوكليوتيد اما جزيئة الـ DNA فعند معاملتها مع حامض الهيدروكلوريك (1.6) عياري تتحرر كافة القواعد النتروجينية من مشتقات عائلة البيورين.

3. الأكسدة بواسطة البيرأيوديت : Periodate : عند معاملة الأحماض النووية مع محلول البيرأيوديت، وبوجود احد الأمينات الألفاتية كعامل مساعد، تزاح النيوكليوتيد الطرفية من الحامض النووي، وكما موضح في المعادلة التالية :

​