يمكن للبنى الثانوية أن تشكل أشكالا أو بنى فوق ثانوية Supersecondary structure

تعمل الأشكال البنيوية الثانوية (الحلزونات ألفا أو الصفيحات بيتا) في العديد من البووتينات الكروية على تشكيل «بنى فوق ثانوية» واضحة المعالم. ويظهر (الشكل 6-9) عدداً من هذه البنى:

1     -β−α−β: طاقان من الصفائح بيتا متصلان بحلزون ألفا.

2     - العرى بيتا المنعطفة على شكل حوف U أو ملقط الشعر بيتا (p-hairpin)

صفائح بيتا متعاكسة التوازي مرتبطة بعروة قصيرة.

3     — المفتاح اليوناني (Greek Key): وتشير تسميته إلى شبهه ببعض الرسوم

التزيينية على الأواني اليونانية القديمة.

وقد تتكرر هذه الأشكال فوق الثانوية لتشكل بنى مميزة كما يحدث عند التكرار المنتظم لوحدات B-a-B في البروتين بكامله (الشكل 6-10).

الشكل 6-9 : الأشكال البنيوية فوق الثانوية. تكون الحلزونات ألفا والصفائح المتثنية بيتا للعديد من البروتينات الكروية مرتبة في وحدات متكررة كالمفتاح اليوناني (على الأيسر) أو البنية ما فوق الثانوية بيتا - ألفا - بيتا (في الأمن).

وتعبر تسمية «البنية الثالثية عن العلاقة الفراغية بين المكونات البنيوية الثانوية. وغالباً ما تنتظم البنى الثانوية وفوق الثانوية لببروتينات الكبيرة في حقول (Domains)، التعبير الذي يشير الى الوحدات المكتنزة المتنصلة بالهيكل الأساسي لعديد الببتيد. ويحصل تطوي عديد الببتيد ضمن الحقل الواحد عادة بشكل مستقل عن تطوي الحقود الأخرى. وتصف البنية الثالثية العلاقات بين هذه الحقل، والطرق التي من خلالها يؤدي تطوي البروتين إلى إحداث تقارب بين الأحماض الأمينية المتباعدة أصلا في البنية الأولية، وأخيراً الروابط التي تثبت هذه الهيئات الفراغية.

شكل 6-10 : البنية الثالثية. تبدو في الشكل مصاوغة التريوز فسفات وقد بنيت من أربع وحدات من البنية بيتا - ألفا - بيتا والتي تأتي متتابعة في البنيتين الأولية والثالثية.

159