مكنون القناة الهضمية الميكروبي Gut Microbiome

مجمع الاحياء المجهرية التي تضمها القناة الهضمية الأحياء التي يستفاد منها فــــــــــــي جسم الإنسان مقابل ان تؤدي فوائد للمضيف لغرض إدامـــــــــــــــــة العلاقة السليمـــــــــــــــــة . وتقع دراسات هذا الموضوع ضمن مـــــــا يسمى (Metagenomic of Human Intestinal Tract ( MetaHIT ويركز هذا الحقل على معرفة الفلورا الميكروبية في حالة السمنة وأمراض الجهاز الهضمي الأخرى ، ويكون التركيز على الجينات والبروتينات التي تنتجها . وهذا المجال  يعد الجزء المكمل لمشروع  Human Microbiome Project  الذي يهدف الى تحديد التواليات لمئات من الجينومات البكتيرية ووضعها في قواعد بيانات.
تستعمل طرق تحديد تواليات جينات 16S rRNA في الكشف عنها نظرا لان 80 % من الأحياء غير قابلة للزرع . وأشارت الدراسات الى الاختلاف بين البالغين والأطفال وأوضحت دراسة الجينوم البيئي الى وجود حوالي 9 % من البكتريا المتعايشة في الأمعاء و 4 % أحياء مرضية و 2.7 % مجاميع أخرى وهذه النسب تختلف في الأطفال . وفضلا عن الاختلافات الكبيرة بين الأشخاص توجد الاختلافات في مجموعة البالغين البدينين والنحفاء مما يشير الى العلاقة الوثيقة بين فلورا القناة الهضمية والسمنة . والملاحظ ان انخفاض الوزن في البدينين يؤدي الى تقارب في الفلورا لتصبح تشابه النحفاء ومن هذه الدراسات يمكن مقارنة النتائج لمعرفة إمكانية استعمال الأدوية أو الأحياء العلاجية لتشكيل الفلورا الملائمة . وكذلك وجود الاختلافات في حالة الصحة والمرض التي تتمثل في العلاقة الوثيقة بين (Inflammatory Bowel Disease ( IBD وفلورا الأمعاء ، اذ ان المصابين يكون التنوع عندهم منخفضا مقارنة بالأصحاء . وتظهر الاختلافات بين التوائم المتماثلة ولكن بشكل اقل حدة .