تتألف الجزيئات Molecules من ذرات ضمت إلى بعضها بواسطة روابط ضمن ترتيبات معينة. ويمكن للجزيئات أن تكون ثنائية الذرة  Diatomic أوثلاثية الذرة Triatomic أوحتى أكبر من ذلك. فأكسيد الآزوت جزيء ثنائي الذرة لأنه يحوي ذرتين، أما الماء H₂O وثنائي اكسيد الكربون CO₂  فهي جزيئات ثلاثية الذرة لأن كل منها يحوي ثلاث ذرات. ويعد الحمض النوويDNA  جزيئا أكبر لأنه يحوي ملايين الذرات.