الجينات الفايروسية وشفرتها الجينية

الجين Gene (المورث) هو تعاقب معين لعدد من النيوكليوتايدات في الدنا المزدوج dsDNA في كل الكائنات الحية ويبلغ حجم ذلك التعاقب 300-6000 زوج من النيوكليوتايدات واللازم لتشفير سلسلة متعدد ببتيد أو حامض نووي ناقل tRNA ويتراوح وزنه الجزيئي بين 100 ألف إلى مليون دالتون. أما الجين الفايروسي فانه تعاقب نيوكليوتايدي معين سواء في الرنا أو الدنا وحسب نوع الفايروس والذي يشفر البروتين التركيبي للكابسيد أو البروتينات الوظيفية الفايروسية وهي إنزيمات التضاعف وبروتينات الحركة والنقل بالناقل. يحسب حجم الجين بضرب عدد الأحماض الأمينية الموجودة في سلسلة عديد الببتيد المعني × 3 والناتج هو عدد النيوكليوتايدات في ذلك الجين اللازمة لتشفير سلسلة عديد الببتيد وذلك لان كل ثلاثة نيوكليوتايدات متعاقبة من الدنا أو الرنا الفايروسي والتي يطلق عليها "الكودون" Codon تشفر حامض أميني واحد. تمتلك الفايروسات عددا قليلا من الجينات تتراوح بين 5-20 جينا مقارنة ببكتريا القولون /Esoherichia CO التي تمتلك 400 جينا.

أما الشفرة الجينية الفايروسية Viral genetic Code فهي شفرة تخليق بروتين فايروسي معين وتمثل تعاقبا لعدد من النيوكليوتايدات في الجينوم الفايروسي حيث أن لكل حامض أميني كودون" متخصص يرتبط به ويضعه في موقعه المحدد في سلسة الببتيد عند تكونه في معقد الرايبوسوم، والكودون هو تعاقب لثلاثة نيوكليوتايدات على جزيئة الرنا الناقل tRN وبذلك تصبح تلك الجزيئة مكيفة لتلك الوظيفة Adaptor molecule حيث يكون الكودون الذي تحمله لسحب الحامض الاميني المعين هو كودون متمم لمثيله الموجود على الرنا المراسل mRNA، ويطلق عليه أيضا "الكودون المضاد" Anticodon أو يسمى Complemented Codon، وهكذا يبدأ تخليق البروتين أولا بواسطة كودون منشى" Initiation Codon والذي يوجد على الرنا المراسل والذي يسمى Amber Codon أو Ochre Codon والمتمثل بالتعاقب النيوكليوتايدي UGA الموجود على الرنا المراسل وهو الكودون المسئول عن تشفير سلسلة الببتيد الأولى للبروتين المراد تخليقه. وهناك العديد من الأحماض الامينية التي تشفر بأكثر من كودون، فالحامض الاميني "لايسين" يشفر بواسطة كودونين، فيما يشفر حامض "الفالين" بأربعة كودونات وحامض "السيرين" بستة كودونات وتعرف هذه الظاهرة بمصطلح "Degeneracy".