يثبت التركيب البنائي للإنزيمات بصورة عامه بواسطة صنفين من الأواصر القوية هي الأواصر الببتيدية والأواصر ثنائية الكبريتيد وثلاث أصناف من الأواصر الضعيفة مثل الأصرة الهيدروجينية والآصرة المحبة للماء والآصرة الالكتروستاتيكية بالإضافة إلى أواصر قوى فان در فال وأواصر أيونية والأواصر التناسقية فالتركيب البنائي الأولى للإنزيمات مشتق من الروابط التساهمية للأحماض الأمينية من نوع ألفا المكونة للإنزيمات بواسطة أواصر ببتيدية من نوع ألفا peptide bonds حيث تأخذ السلسلة الببتيدية الشكل الذي يحدد التركيب البنائي المجسم ثلاثي الابعاد للإنزيم من خلال الالتفاف الحلزوني المبروم على طول السلسلة الببتيدية وحول بعضها أو يتكون الإنزيم من سلاسل ببتيدية متعددة قصيرة السلسلة oligomeric enzymes يلتف أو يرتبط بعضها مع البعض الآخر والذي يساعد على ثبات السلاسل مع بعضها وتلك الأواصر أو الروابط الآنفة الذكر والذي تعمل على أحكام تثبيت السلسلة في الأوضاع التي تأخذها الإنزيمات حيث تحصل تداخلات منظمه بواسطة ثلاثة أنواع مختلفة من القوى هي التفاف الجزيئات الإنزيمية وارتباط المادة الأساس إلى الإنزيم والتداخلات الخلوية في الأنظمة الحيوية وتلك التداخلات تحتاج إلى أواصر الكتروستاتيكية وأواصر هيدروجينية وقوى فان در فال وتلك الأواصر اللاتساهمية الأساسية الثلاثة تختلف في متطلباتها الهندسية والقوة والتخصص وهي أيضا تتأثر بطرق مختلفة بوجود الماء، فالمجاميع المشحونة على المادة الأساس تتداخل مع المجموعة المشحونة على الإنزيم مما يسبب ذلك قوى أو تداخلات الكتروستاتيكية وارتباط tyrosine glycyl إلى carboxypeptidase A يسبب أيضا تداخلات الكتروستاتيكية.