في الكثير من الأحيان نحتاج الى قياس مستوى الأنواع المختلفة من بروتينات الدم مجموعات او كل على حدة وذلك من اجل معرفة اي خلل يحدث في مستوياتها بسبب الأمراض ذات العلاقة مما يساعد في تشخيصها.

ومن أجل ذلك فلابد من فصل الأنواع المختلفة من بروتينات الدم عن بعضها البعض وتوجد طرق عديدة تستخدم لهذا الغرض ومن أكثر هذه الطرق استخداما :

1- التجزئة بالمذيبات أو الأملاح ( salt or solvent fractionation ) : وتعتمد هذه الطريقة على الاختلاف في قابلية ذوبان الأنواع المختلفة من بروتينات مصل الدم في المحاليل الملحية وكمثال على ذلك يمكن فصل البومين مصل الدم عن كلوبيولين مصل الدم بإضافة المحلول الملحي كبريتيد الصوديوم ( sodium sulphite ) حيث أن الألبومين يذوب في هذا المحلول بينما الكلوبيولين لا يذوب .

2- النبذ فائق السرعة (Ultracentrifugation ) : حيث تعتمد هذه الطريقة على الاختلاف في الأوزان الجزيئية ( Molecular weights ) للأنواع المختلفة لبروتينات الدم فعند نبذ هذه البروتينات عند سرعة عالية جدا يتم عزل كل منها على حدة اعتمادا على أوزانها الجزيئية .

3-الترشيح خلال الجل (Gel Filtration ) : وتعتمد هذه الطريقة في فصل البروتينات على الاختلاف بين البروتينات المختلفة على المرور خلال مادة الجل اعتمادا على كتلتها الجزيئية ( Molecular masses )

4- التحليل الكيمياوي المحصن ( Immunochemical analysis ) : وتعتمد هذه الطريقة على الاختلاف في سرعة انتشار البروتين خلال ثقب في المادة الهلامية ( gel ) و باتجاه قطر الثقب ( Radial diffusion ) .

5-  الكروماتوكرافي ( chromatography ) : وتعتمد هذه الطريقة على الاختلاف بين البروتينات المختلفة في الانسياب والمرور ( Rate of flow ) خلال وسط كروماتوكرافي ( Chromatographically media ) وذلك اعتمادا على حجم وشكل والشحنة الكهربائية لكل نوع من البروتينات .

6- الترحيل الكهربائي ( Electrophoresis ) : وتعتبر من أكثر الطرق استخداما في مختبرات الكيمياء السريرية وتعتمد هذه الطريقة على اختلاف كثافة الشحنات الكهربائية الموجودة على البروتينات المختلفة بما يؤدي الى اختلاف سرعة هجرة كل منها خلال المجال الكهربائي ( electrical ) potential مما يؤدي الى انفصال كل منها على انفراد .

7- الترحيل الكهربائي المحصن ( Immunoelectrophoresis ) : وتجمع هذه الطريقة بين التحليل الكيميائي المحصن وطريقة الهجرة الكهربائية وهي طريقه اكثر تطورا وتعقيدا وتستخدم في عمليات الفصل الدقيقة جدا للبروتينات حيث تكون اكثر دقة في فصل البروتينات المختلفة عن طريقة الترحيل الكهربائي وخاصة البروتينات التي يكون مستواها في مصل الدم قليل مثل IgE