ينطبق هذا التصنيف على المتعضيات المكروية التي يمكنها تسهيل تفاعلات الاختزال والأكسدة. إن عمليات تفكيك المادة العضوية الموجودة في رواسب بحيرة، أو تربة غابة، أو مِكَبٌ فضلات صلبة، أو محطة معالجة مياه الفضلات، تحصل جميعاً اسطة سلاسل متنوعة من خطوات الأكسدة.

الهوائيات(aerobes)

الهوائيات aerobes هي صنف واسع من المتعضيات المكروية التي تستعمل الأكسجين الجزيئي، غازاً أو منحلاً في الماء، ليكون قابلة إلكترونات في تفاعلات أكسدتها. في هذه السيرورة، يُرجع الأكسجين وتستهلك أيونات الهدرونيوم:

ولكي تكون الأنواع الهوائية نشطة، يجب أن تكون بيئتها على تماس مع كثير من الهواء المحتوي على الأكسجين.

اللاهوائيات(anaerobes)

عندما تكون مبادلة الهواء محدودة وينضب الأكسجين، تصبح المتعضيات الهوائية غير قادرة على الحياة. إلا أن تفاعلات الأكسدة يمكن أن تستمر من خلال أنشطة المتعضيات المكروية اللاهوائية anaerobe التي تتصف بالمقدرة على إحداث الأكسدة من دون الأكسجين الجزيئي. فبدلاً منه، تستعمل اللاهوائيات أنواعاً أخرى فقيرة بالإلكترونات من قبيل الكبريتات لقبول الإلكترونات من القاعدة المُرجَعة وتتحول قابلة الإلكترون إلى صيغة أكثر إرجاعاً: