أقرأ أيضاً
التاريخ: 20-7-2017
1509
التاريخ: 20-2-2020
1754
التاريخ: 8-5-2017
2258
التاريخ: 30-3-2017
4068
|
اصطفاف التواليات المتعددة Multiple Sequence Alignment
صف عدد من التواليات (اكثر من اثنين) وهي من المهام التي تؤديها المعلوماتية الحيوية ومنها ان اصطفاف زوج من التواليات يكون غير كافيا لعدد من الأغراض ، لذلك يتم اللجوء الى اصطفاف عدد من التواليات( MAS ) وتعني صف ثلاث او أكثر من التواليات الحيوية مثل البروتينات او DNA او RNA فيما بينها وليس مع قواعد البيانات وفي العادة تكون هذه التواليات ذات أصول مشتركة اي بينها علاقة تطورية سواء كانت قوية او متباعدة ،لذلك تكون هذه المهامة ذات أهمية كبيرة في علم الحياة الجزيئي الحاسوبي لانها توفر معلومات بايولوجية أكثر من صف زوج من التواليات. ومن صف التواليات المتعددة يمكن التعرف على مدى التماثل وكذلك التشابه والتماثل . وزيادة درجات التشابه تؤدي في النهاية الى استنتاج التماثل وان التواليات تعود الى أصول مشتركة.
لذلك كان لاصطفاف عدد من التواليات أهمية في إيجاد العلاقات وأشجار التطور وذلك باستهداف صف تواليات الدومينات التي تقوم بالفعاليات وهذه تكون أهم من صف التواليات الكاملة نفسها لان اصطفاف المناطق الثابتة (مثل الدومينات) التي تكون في الغالب مهمة من النواحي الوظيفية يمكن إيجادها بطريقة الاصطفاف المتعددة ، وتمكن الطريقة من التعرف على مواقع الفعاليات المهمة مثل مواقع الارتباط، والمواقع الفعالة للإنزيمات وغيرها من المواقع النشطة في أداء وظائف معينة.
ويلعب هذا النوع من الاصطفاف دورا مهما في إيجاد التراكيب الثانوية والثلاثية للبروتينات وبذلك فهي تساعد في إيجاد العلاقة بين تركيب ووظيفة البروتينات. وتستعمل في تصميم البوادئ Primers ، فضلا عن ان بعض برامجها يمكن ان تظهر الفجوات في التواليات وكذلك مواقع حدوث الطفرات او طفرات الحذف والإقحام (Indels) . واكثر البرامج اهمية في هذا المجال هي حزمة برامج Clustal . ويمكن لبعض البرامج ايضاح و ظيفة او التركيب الثانوي للتواليات .
|
|
5 علامات تحذيرية قد تدل على "مشكل خطير" في الكبد
|
|
|
|
|
لحماية التراث الوطني.. العتبة العباسية تعلن عن ترميم أكثر من 200 وثيقة خلال عام 2024
|
|
|