لجبال الهملايا تأثير كبير على المناخ في شبه القارّة الهندية وهضبة التبت؛ فهي تمنع البرد الشديد والرّياح الجافة من أن تهبّ جنوباً إلى شبه القارة الهندية، ممّا يؤدّي إلى بقاء جنوب آسيا أكثر دفئاً مقارنةً بالمناطق الأخرى في باقي القارات، كما وتُشكّل حاجزاً للرياح الموسمية، ويُعتقد كذلك أنّ لها دورٌ كبيرٌ في تشكيل صحاري آسيا الوسطى. تعدّ الهملايا ثالث أكبر مخزون للجليد والثلج في العالم بعد القارّة القطبية الجنوبية والقطب الشمالي، وتشمل حوالي 15,000 نهراً جليدياً، تُخزّن فيه حوالي 12,000 كيلومترٍ تكعيبيٍّ من المياه العذبة.