النماذج الايضية للخلايا حقيقية النواة eucartotic cells تتأثر بوجود التقسيمات الحلال لسكر، مسلك فوسفيت السكر الخماسي وتخليق الأحماض الدهنية تحدث في السايتوسول بينما أكسدة الأحماض الدهنية ودورة حامض الستريك والفسفرة التأكسدية تتم في المايتوكوندريا، بعض العمليات مثل تخليق السكر من مصادر غير كربوهيدراتية وتخليق اليوريا تعتمد على التفاعلات التي تحدث في كلا التقسيمات، مصير بعض الجزيئات يعتمد على فيما إذا كانت تقع في السايتوسول أو في المايتوكوندريا وكذلك مرورها خلال غشاء المايتوكوندريا الداخلي الذي يجب أن يكون المرور منظم، فعلى سبيل المثال يحصل تحليل سريع للأحماض الدهنية المنقولة إلى المايتوكوندريا بالمقارنة مع الأحماض الدهنية في السايتوسول الذي تتم استرتها أو نقلها ويتم نقل الأحماض الدهنية طويلة السلسلة إلى حشوة المايتوكوندريا بشكل استرات كارنتين مما يسهل ذلك من حملها ومرورها خلال الغشاء المايتوكوندريا الداخلي، أن موقع الإنزيمات في دورة حامض الستريك أما في الغشاء الداخلي أو في الحشوة الداخلية، حيث ترتبط بدورة حامض الستريك عدد كبير من المرافقات الإنزيمية مثل NAD⁺, FAD, TPP lipoic acid, CoA-SH والعوامل المرافقة مثل Mg⁺², ADP, GDP يمكن فصلها بسهولة