لا تستطيع اللاهوائيات الاجبارية ان تنمو في الانسجة السليمة وذلك لمحتواها الاوكسجيني. وعندما تصاب الانسجة يتم تحديد تزويدها بالدم والاوكسجين، وبذلك يتم توفير ظروف ملائمة للنمو الانتهازي للبكتريا اللاهوائية الاجبارية، بحيث يمكن ان يصيب اكثر من نوع بكتيري واحد لنفس الموقع. وان حدوث اصابة متزامنة بالبكتريا اللاهوائية الاختيارية facultative anaerobes (والتي تستخدم بالفعل الامداد الاوكسجيني المتضائل ) يشجع على نمو البكتريا اللاهوائية الاجبارية.

كما ان جميع انواع اللاهوائيات المتواجدة في النبيت الطبيعي للإنسان هي من الانواع غير المكونة للسبورات البكتيرية وغالبا ما تحدث الاصابات اللاهوائية من هذا المصدر. مع  ذلك فأن تلوث الجروح يمكن ان يُحدث اصابات بالبكتريا اللاهوائية المكونة للسبورات (مثل بكتريا Clostridium) وهذه الانواع البكتيرية شائعة في البيئات المحيطة مثل التربة. كما ان انتاج السموم الخارجية exotoxins في اللاهوائيات الغير مكونة للسبورات يكون نادرا على العكس من اللاهوائيات المكونة للسبورات.

وتظهر البكتريا اللاهوائية الاجبارية بأعداد كبيرة في الامعاء (تشكل 95-99% من مجموع الكتلة الجرثومية)، كما تتواجد ايضا في الفم وفي المسالك البولية التناسلية وخاصة للإناث، وان اغلب الإصابات الشائعة التي تنتج من العمليات الجراحية الباطنية او من خلال الاصابات المعوية الاخرى هي بواسطة العائلة المعوية Enterobacteriaceae (انواع بكتيرية لاهوائية اختيارية) وبكتريا Bacteroides fragilis (لاهوائية اجبارية) وهي تشكل المكون الأقل للنبيت الطبيعي في القناة المعوية وهذا يوضح نقطة مهمة في ان هنالك كائنات معينة اكثر استعدادا لإحداث اصابات انتهازية من غيرها.

التشخيص في المختبرات السريرية

هنالك نوعان من الانظمة الشائعة الاستعمال: النظام البايوكيمائي و/ او التشخيص بواسطة كروموتغرافيا الغاز gas chromatographic لمنتجات التخمير المتطايرة (مثل الاحماض الدهنية ذات السلاسل القصيرة والكحولات).

كما ان هنالك دائماً مشاكل ترافق عملية تشخيص الاصابات بالبكتريا اللاهوائية وذلك لإنها في كثير من الاحيان تستحصل من النبيت الطبيعي (تتواجد طبيعياً فيه). لذا يجب على المرء ان يتأكد من انها ليست معزولة من الملوثات. كما يجب الانتباه الى ان لا تختلط النماذج اثناء عزلها او نقلها الى المختبرات السريرية بالهواء، فعندها يمكن ان تكون البكتريا غير قابلة للعزل. كما ان النمو البطيء للبكتريا (بسبب ضعف كفاءة عمليات التخمير) يعني ان عملية العزل يمكن ان تأخذ عدة ايام أو أكثر.

اللاهوائيات الغير مكونة للسبورات والمهمة سريريا

• العصويات السالبة لكرام مثل Bacteroides ( ومنها Fusobacterium, (B. fragilisو 

• العصويات الموجبة لكرام مثل Eubacterium  و Arachnia  و   Actinomyces ,Propionibacterium, Lactobacillus, Bifidobacterium,

• المكورات الموجبة لكرام مثل Peptostreptococcus و Peptococcus.

• المكورات السالبة الكرام مثل Veillonella و Acidominococcus

بکتریا Bacteroides fragilis

وهي من اهم الانواع البكتيرية اللاهوائية الاجبارية الغير مكونة للسبورات التي تسبب امراضا سريرية. وتمتلك محفظة مميزة تشترك في امراضيتها طالما انها مضادة لعملية البلعمة anti- phagocytic واشتراكها المباشر في تكوين الخراجات.

كما وتنتج هذه البكتيريا الذيفانات الداخلية endotoxin والتي تختلف في تركيبها عن الذيفان الداخلي النموذجي ويمتاز أيضا بسمة منخفضة .