المرجع الالكتروني للمعلوماتية
المرجع الألكتروني للمعلوماتية

علم الاحياء
عدد المواضيع في هذا القسم 10753 موضوعاً
النبات
الحيوان
الأحياء المجهرية
علم الأمراض
التقانة الإحيائية
التقنية الحياتية النانوية
علم الأجنة
الأحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
المضادات الحيوية

Untitled Document
أبحث عن شيء أخر المرجع الالكتروني للمعلوماتية

البطن غير مخالف للظاهر
16-10-2014
collective (adj.)
2023-07-06
زراعة الدخن
16/11/2022
Two trips
29/9/2022
السيد حسين بن كمال الدين بن الأبزر
23-6-2017
الفيتامينات  Vitamines
18-5-2016


التجميع الإنزيمي للبتيد السباعي للفانكوميسين وكلوروإرموميسين (chloroermomycin)  
  
77   01:14 صباحاً   التاريخ: 2025-01-11
المؤلف : كريستوفر والش , ترجمة أ.د حنان احمد حبيب باباي
الكتاب أو المصدر : المضادات الحيوية ( طرق العمل , المصادر , المقاومة )
الجزء والصفحة : ص216-219
القسم : علم الاحياء / المضادات الحيوية / مواضيع عامة في المضادات الحيوية /


أقرأ أيضاً
التاريخ: 24-3-2016 1056
التاريخ: 16-2-2018 763
التاريخ: 24-3-2016 2348
التاريخ: 25-4-2019 649

للفانكوميسين وكلوروإرموميسين هيكل ببتيد سباعي ذا ربط – تبادلي مشابه وكتلة جين البناء الحيوي لكلوروإرموميسين، ولكن ليست بعد للفانكوميسين ، قد وجد أنها تحتوي على كتلة من بعض 30 جين (1998 ,.Van Wageningen et al)  الشكل (1) . والجدير بالذكر في هذه الكتلة ثلاثة أطر قراءة مفتوحة كبيرة جداً،  ORFs 4 to 6  ، التي ترمز الوحدات الفرعية الثلاث CepA, CepB ، وCepC من NRPS hepapeptide synthetase. ومعاينة ترتيب الحقل المفترض من التحليل المعاوماتية الحيوي (الشكل 2) يظهر 24 حقل موزعة فوق الثلاث وحدات الفرعية، مع الوحدات التي تحتوي على CepA  1إلى 3، الوحدات CepB 4 إلى 6 ، والوحدة السابعة CepC. والمنطق المستعمل لـ ACV ترايببتيد سنثيتاز هو قابل للانتقال لخط تجميع NRPS هذا. وسبعة  أحماض أمينية في الببتيد السباعي تلزم حقول سبعة A وسبعة حقول PCP مقترنة بالشكل HS-pantetheinyl holo لتكون وظيفية. وتوجد ستة روابط ببتيد لتصنع و 6 حقول. كما توجد أربعة أحماض امينية-دي (D-amino acids) في الأحلقي السباعي (D,D,L,D,D,L,L-acyclic heptamer). وتوجد حقول التزامر في الوحدات 2، 4 و 5 ولكن ليس في الوحدة 1. وأخيراً، هيكل الببتيد السباعي في المنتج الطبيعي هو الحامض الحر وحقل TE يفترض بأن يكون الإنزيم المذوب لببتيديل السباعي – heptpeptidyl-S-PCP, hydrolase) S-PCP7). ومصدر D-Leu عند الفضالة الولى مازال غير معروف، ولكن الحقل A يستطيع أن ينشط كل من L- Leu و D-Leu ويغرس D-Leu على HS-PCP المجاور من الوحدة 1 ( 2000 ,Trauger and Walsh).

وإذا كان الحقل C للوحدة 2 هو D-specific خاص للمانح Leu1، بعد ذلك يمكن حل المسألة. وافتراضياً الحقل C في الوحدة 3 هو خاص للمانح D-D-dipeptidyl ولكنه مستقبل L-Asn-S-PCP3 ، بينما حقل C في الوحدة 5 سوف يفترض بأنه يميز مانح الإنزيم D-D,L,D-tetrapeptidyl-S-enzyme ومستقبل D-4-OH-phcGly-S-PCP. والنوعية شیرال (chiral specificity الحقول لم يتم بعد التحقق من صحتها تجريبياً.

شكل رقم (2) 24 حقل, سبعة خطوط تجميع الوحدة للعمود الفقري للببتيد السباعي لكلوروارومومسين او فانكومايسين سينثتاز

والخاصية الأخيرة الجديرة بالذكر في خط تجميع الببتيد السباعي هذا هي إستعمال إثنين من موحودات الحمض الأميني الغير مولد للبروتين ، D-4-OH-pheGly عند المواضع 4 و 5 و  3.5-(OH)2 -PhyGlyعند الموضع 7. وجميع سلاسل أريل الجانبية – الغنية بالإلكترون تشارك في تفاعلات الربط – التصالبي لما – بعد – خط – تجميع NRPS. يُصنع 4-OH-pheGly وموحودات 3.5-(OH)2 -PhyGly كـ L-isomers بواسطة الإنزيمات التي ترمز كذلك في كتلة البناء الحيوي . تؤدي أربعة مسارات – إنزيم من كوريسميت (horismite) عن طريق بارا-هيدروكسيفينيل بيروفيت (para-hydroxyphenylpyruvate) وبارا هيدروکسیماندیلیت (-para hydroxymandelate) إلى (1,17,21,22 4-OH-pheGly (ORFs، بينما 3,5-dihydroxy isomer  تشتق بدلا من ذلك ومن النوع III PKS يتبعها الثلاث إنزيمات من عائلة كروتوناز (crotonase) الضخمة 30 ORFs 27 to في الشكل 1)

مستعملة أسيل – CoAs في تكثيفات كلايزين التكرارية (iterative Claisen condensations) لبناء الحمض الأميني – ذي الثمانية كربون المندمج عند الفضالة 7 (2002 ,.Chen et al). وهذه الثمانية ORFs تؤكد على تنسيق التنظيم والالتزام لإنتاج موجودات الحمض الأميني غير المولدة للبروتين في قاعدة في – الوقت المحدد وتصادق على تقلبات (تعددات) NRPS لحقول A لتدخل التغيرات في خطوط – تجميع الببتيد في قالب ثيو.

 

References

1- Chen, X., S. Schauder, N. Potier, A. Van Dorsselaer, I. Pelczer, B. L. Bassler, and F. M. Hughson. 2002. Structural identification of a bacterial quorum-sensing signal containing boron. Nature 415:545-549.

2- Trauger, J. W., and C. T. Walsh. 2000. Heterologous expression in Escherichia coli of the first module of the nonribosomal peptide synthetase for chloroeremomycin, a vancomycin- type glycopeptides antibiotic. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97:3112-3117.

3- van Wageningen, A. M., P. N. Kirkpatrick, D. H. Williams, B. R. Harris, J. K. Kershaw, N. J. Lennard, M. Jones, S. J. Jones, and P. J. Solenberg. 1998. Sequencing and analysis of genes involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. Chem. Biol. 5:155- 162.




علم الأحياء المجهرية هو العلم الذي يختص بدراسة الأحياء الدقيقة من حيث الحجم والتي لا يمكن مشاهدتها بالعين المجرَّدة. اذ يتعامل مع الأشكال المجهرية من حيث طرق تكاثرها، ووظائف أجزائها ومكوناتها المختلفة، دورها في الطبيعة، والعلاقة المفيدة أو الضارة مع الكائنات الحية - ومنها الإنسان بشكل خاص - كما يدرس استعمالات هذه الكائنات في الصناعة والعلم. وتنقسم هذه الكائنات الدقيقة إلى: بكتيريا وفيروسات وفطريات وطفيليات.



يقوم علم الأحياء الجزيئي بدراسة الأحياء على المستوى الجزيئي، لذلك فهو يتداخل مع كلا من علم الأحياء والكيمياء وبشكل خاص مع علم الكيمياء الحيوية وعلم الوراثة في عدة مناطق وتخصصات. يهتم علم الاحياء الجزيئي بدراسة مختلف العلاقات المتبادلة بين كافة الأنظمة الخلوية وبخاصة العلاقات بين الدنا (DNA) والرنا (RNA) وعملية تصنيع البروتينات إضافة إلى آليات تنظيم هذه العملية وكافة العمليات الحيوية.



علم الوراثة هو أحد فروع علوم الحياة الحديثة الذي يبحث في أسباب التشابه والاختلاف في صفات الأجيال المتعاقبة من الأفراد التي ترتبط فيما بينها بصلة عضوية معينة كما يبحث فيما يؤدي اليه تلك الأسباب من نتائج مع إعطاء تفسير للمسببات ونتائجها. وعلى هذا الأساس فإن دراسة هذا العلم تتطلب الماماً واسعاً وقاعدة راسخة عميقة في شتى مجالات علوم الحياة كعلم الخلية وعلم الهيأة وعلم الأجنة وعلم البيئة والتصنيف والزراعة والطب وعلم البكتريا.