بالإضافة إلى النوعين المشهورين من ميكروسكوبات المسبار الماسح، توجد أنواع مختلفة أخرى لا يزال البعض منها قيد البحث والتطوير نذكر منها الأنواع التالية:

– ميكروسكوب القوة المغناطيسية Magnetic Force Microscope.

– ميكروسكوبات الليزر الماسح Laser Scanning Microscopes.

– الميكروسكوبات الضوئية الماسحة قريبة الحقل Scanning Optical Microscopes Near–Field

وتتميز هذه الأنواع المبتكرة من ميكروسكوبات المسبار الماسح، بدقتها العالية وقدرتها الفائقة على تعيين خواص متعددة لسطح عينة المادة، منها:

– تحديد البنية الإلكترونية عند درجات الحرارة المنخفضة.

– تحديد التركيب الكيميائي.

– تعيين الخواص البصرية.

– تعيين الخواص الحرارية.