أمّا مناظراته مع المخالفين فحدّث عنه ولا حرج، وقد جمعها العلاّمة الطبرسي في كتاب الاحتجاج.

قال الشيخ المفيد في الارشاد: وجاءت الاخبار: انّ نافع بن الأزرق جاء الى محمّد بن علي فجلس بين يديه يسأله عن مسائل الحلال والحرام.

فقال له أبو جعفر في عرض كلامه : قل لهذه المارقة، بم استحللتم فراق امير المؤمنين، وقد سفكتم دماءكم بين يديه في طاعته والقربة الى الله بنصرته؟ فسيقولون لك : إنّه حكَّم في دين الله، فقل لهم: قد حكّم الله تعالى في شريعة نبيّه (صلى الله عليه وآله) رجلين من خلقه فقال : {فَابْعَثُوا حَكَمًا مِنْ أَهْلِهِ وَحَكَمًا مِنْ أَهْلِهَا إِنْ يُرِيدَا إِصْلَاحًا يُوَفِّقِ اللَّهُ بَيْنَهُمَا} [النساء: 35] .

 وحكَّم رسول الله (صلى الله عليه وآله) سعد بن معاذ في بني قريظة فحكم فيهم بما امضاه الله، أوما علمتم أنّ امير المؤمنين إنّما امر الحكمين أن يحكما بالقرآن ولا يتعدّياه، واشترط ردّ ما خالف القرآن في أحكام الرجال، وقال حين قالوا له : حكّمت على نفسك من حكم عليك؟ فقال : ما حكّمت مخلوقاً وإنما حكّمت كتاب الله.

 فأين تجد المارقة تضليل من امر بالحكم بالقرآن، واشترط ردّ ما خالفه لولا ارتكابهم في بدعتهم البهتان؟ فقال نافع بن الازرق : هذا والله كلام ما مرّ بسمعي قط ولا خطر منّي ببال، وهو الحقّ إن شاء الله.