تعيين الطرف الأميني للبروتين (N-terminal amino acid) 

من الطرق المعتمدة في تحديد الحامض الاميني الذي يحتل الموقع الاميني، طريقة سانجر والمتضمن استخدام المركب العضوي : 1- فلورو، 4،2 – ثنائي نيترو بنزين (1- Fluoro, 2,4- dinitrobenzene) في محيط قاعدي ضعيف ، فعند استخدام ببتيد ثلاثي نحصل على النتائج التالية :

بعد معاملة ناتج التفاعل مع حامض الهيدروكلوريك (6NHCI) تكسر الروابط بين الاحماض الامينية في السلسلة الببتيدية، عدا الرابطة التي تربط بين 1- فلورو، 4,2 ثنائي نيترو بنزين والحامض الأول الذي يمثل الموقع الطرفي من الجانب الاميني وهو في هذه الحالة حامض ألآلانين (DNP- alanine)، وكما هو موضح في المعادلات الكيميائية في أعلاه. كما يمكن استخدام أنزيمات الببتايديز الخارجية (exopeptidase) للكشف عن الحامض الاميني الذي يحتل الموقع الاميني (N- terminal amino acid)، بدلا من العوامل الكيميائية، ويتلخص عمل الأنزيم بمهاجمة الرابطة الببتيدية التي تربط بين الحامض الأميني الذي يحتل الموقع الأميني والحامض الاميني الثاني في السلسلة الببتيدية، محرراً الحامض الأميني الطرفي، ويعاود الأنزيم مهاجمة الببتيد الجديد محرراً الحامض الاميني الطرفي وهكذا تستمر العملية لغاية الحامض الاميني الخامس عشر في السلسلة الببتيدية، ويكون عمل هذا الأنزيم مشابه لتفاعل أدمان.