Heteroduplex

Two single-stranded nucleic acid polymers with at least partial complementarity can form duplexes with stretches of double helix, corresponding to the regions of nucleotide sequence homology, interleaved with unpaired stretches, corresponding to noncomplementary regions. Two types of single-stranded loops are introduced by noncomplementarity in the heteroduplex (Fig. 1). A loop in only one of the strands indicates a deletion. A loop composed of single-strand regions in both strands indicates a region of sequence incompatibility. A heteroduplex can be composed of two DNA strands, one DNA strand and one RNA strand, or two RNA strands. In vivo, heteroduplexes (DNA–DNA) can arise in the process of recombination or as a consequence of errors (mismatches) in DNA replication (DNA–DNA) or transcription (DNA–RNA). Hybridization of nucleic acids of different origins leads to heteroduplexes in vitro. 

Figure 1. Loops in a heteroduplex indicate either a deletion or a region of noncomplementarity in the two strands.

The level of sequence homology in the heteroduplex can be evaluated by monitoring the change in ultraviolet absorbance on heteroduplex formation or by selective enzymatic digestion of single-stranded regions, followed by hydroxyapatite chromatography. These techniques are analogous to those used for studies of reassociation kinetics (1).

Electron microscopy can used to visualize the regions of sequence homology in the heteroduplex, even though nucleic acids are not sufficiently dense to be easily observable directly in the electron microscope. The heteroduplex is spread on the surface of the electron microscope grid. Heavy metals and proteins are applied to the nucleic acid by one of several techniques, thereby making the polymers visible in the electron microscope.

References

1. R. J. Britten, D. E. Graham, and B. R. Neufeld (1974) Meth. Enzymol. 29, 363.

اخر الاخبار

اخبار العتبة العباسية المقدسة

العتبة العباسية المقدسة تنظّم مسيرات عزائية لإحياء ذكرى عاشوراء في نينوى

قسم الشؤون الفكرية يحيي ذكرى استشهاد الإمام الحسين (عليه السلام) في القارة الإفريقية

قسمُ التربية والتعليم يقيم مجلسه العزائي السنوي بذكرى عاشوراء

معهد القرآن الكريم النسوي يُقيم مجلس عزاء حسيني إحياءً لذكرى عاشوراء

المزيد

الآخبار الصحية

تناول الجبن.. مفيد للجسم أم خطر يهدد صحتك؟

طبيبة أسنان تحذر.. لا تتجاهل هذه العلامة بعد التنظيف

يجب أن تأكل المزيد من الشمام هذا الصيف.. إليك السبب ؟

تأثير صحي كبير.. كم بيضة يجب أن تتناول يوميا؟

المزيد

الآخبار التكنلوجية

أداء خلايا البيروفسكايت الشمسية تحت الماء قد يزيد كفاءة تحويل الكهرباء

مسافة الأمان: أساس القيادة الآمنة وتجنب الحوادث

هل القيادة السريعة تعني استهلاك اكثر للوقود؟

لماذا يعتبر كوكب المريخ غير صالح للحياة؟

المزيد

مواضيع ذات صلة

Chronology of Becoming a Lysogen

N Protein and Antitermination of Early Gene Transcription

Spontaneous Mutations in bacteria

Mechanisms of Gene Transfer in Bacteria

Phage Replication

Genotoxicity Through Potential Off-target Nuclease - Induced Double - Strand Breaks

A Broad Range of Genomic Changes by Homologous Recombination–Mediated Genome Editing

Early Transcription of Genes N and Cro

Lambda’s Relatives and Lambda Hybrids

The Genetic Structure of Lambda

The Physical Structure of Lambda

Other Attenuated Systems: Operons, Bacillus subtilis and HIV