النصوص الدالة على إمامته ، والأثار الواردة في الإشارة إليه ، فمن ذلك : ما رواه محمد بن يعقوب الكليني ، عن أحمد بن إدريس، عن محمد ابن عبدالجبّار، عن أبي القاسم الكوفي ، عن محمد بن سهل ، عن إبراهيم ابن أبي البلاد، عن إسماعيل بن محمد بن عبدالله بن عليّ بن الحسين ، عن أبي جعفر (عليه السلام) قال : لمّا حضرت عليّ بن الحسين (عليهما السلام) الوفاة أخرج سفطاً أو صندوقاً عنده فقال : يا محمد احمل هذا الصندوق ،قال : فحمل بين أربعة، فلمّا توفّي جاء إخوته يدّعون في الصندوق سهماً ،قال : واللهّ مالكم فيه شيء ، ولو كان لكم فيه شيء ما دفعه إلي ، وكان في الصندوق سلاح رسول الله (صلى الله عليه واله) وكتبه. 

وقال : أما إنه لم يكن فيه دينار ولا درهم ولكن كان مملوءاً علماً.

وعنه ، عن محمد بن الحسن ، عن سهل بن زياد، عن محمد بن عيسى، عن فضالة بن أيّوب ، عن الحسين بن أبي العلاء، عن أبي عبدالله (عليه السلام) قال : سمعته يقول : إنّ عمر بن عبدالعزيز كتب إلى ابن حزم أن يرسل إليه بصدقة عليّ وعمر وعثمان ، وإنّ ابن حزم بعث إلى زيد بن الحسن وكان أكبرهم فسأله الصدقة، فقال زيد : إنّ الوليّ كان بعد علي الحسن ، وبعد الحسن الحسين ، وبعد الحسين عليّ بن الحسين ، وبعد عليّ بن الحسين محمد بن علي ، فابعث إليه ، فبعث ابن حزم إلى أبي فأرسلني أبي بالكتاب فدفعته إلى ابن حزم ، فقال له بعضنا : يعرف هذا ولد الحسن ؟ قال : نعم كما تعرفون أنّ هذا ليل ، ولكن يحملهم الحسد، ولو طلبوا الحقّ بالحقّ لكان خيراً لهم ولكنّهم يطلبون الدنيا.

وأما النصوص المرويّة عن النبيّ (صلى الله عليه واله) في جملة الاثني عشر فكثيرة ، مثل خبر اللوح الذي هبط به جبرئيل على رسول الله (صلى الله عليه واله) من الجنّة فأعطاه فاطمة عليها السلام  ومثل ما روي : أنّ الله تعالى أنزل إلى النبيّ (صلى الله عليه واله) كتاباً مختوماً باثني عشر خاتماً وأمره أن يدفعه إلى أمير المؤمنين (عليه السلام) ويأمره بان يفضّ أول خاتم فيه فيعمل بما تحته ، ثم يدفعه عند وفاته إلى الحسن (عليه السلام) ويأمره بفض الخاتم الثاني ويعمل بما تحته ، ثم يدفعه عند حضور وفاته إلى الحسين (عليه السلام) فيفض الخاتم الثالث ويعمل بما تحته ، ثمّ يدفعه الحسين عند وفاته إلى عليّ بن الحسين ويأمره بمثل ذلك ، ثمّ يدفعه عند وفاته إلى ابنه محمد بن عليّ ويأمره بمثل ذلك ، ثم يدفعه إلى ولده حتّى ينتهي إلى آخر الأئمة (عليهم السلام).